Действия сериала происходят в фэнтезийном мире, полном таинственных рун, которые, согласно легендам, переполнены древней магией. Однако никто не знает, где они находятся. История расскажет об авантюристах, которые пытаются найти эти артефакты. События аниме будут основаны на ивенте «Нулевая хроника: Первый грех», который посвящён третьей годовщине игры. Данный ивент служит краеугольным камнем основной истории. Его события разворачиваются за сотни лет до основной истории, описывая её прошлое.

Небольшой скучный городок, вроде бы среднестатистический старшеклассник Сюити Кагая — обычный набор для развития необычной истории. Сюжет завязывается, когда красавица-одноклассница Сюити, Клэр Аоки, оказывается в огненной ловушке на складе и Сюити вынужден использовать свою загадочную способность. Он может превращаться в большую собаку, у которой на спине молния, а на боку — револьвер. Кагая спасает девушку, раскрывая тем самым свой секрет. Однако оказывается, что у Клэр свой скелет в шкафу: её семью убила собственная сестра Клэр. И теперь Аоки жаждет разыскать сестру чего бы это ни стоило, поэтому она решает использовать парня и его силу в своих целях...

Когда-то мир представлял собой безжизненную пустошь, но однажды с неба спустилась богиня, открыв гигантские Врата. За ними люди обнаружили чудесную энергию, которая была способна наполнить мир жизнью. Со временем вокруг Врат образовался город, а сбор энергии в подземелье за Вратами стал уделом профессионалов из добывающих компаний. Директором одной из таких компаний становится главный герой Минато.

История разворачивается в итальянском городе Флоренция начала XVI века — родине Ренессанса, где процветают живопись, скульптура и другие виды изобразительного искусства. Поддавшись влиянию этой энергичной и яркой эпохи, юная аристократка по имени Арте ещё в детстве загорается страстью к рисованию. Однако, будучи пленницей своего времени, когда жизнь женщины вне семьи не представлялась возможной, девушка не может в полной мере наслаждаться любимым делом. Ссоры с матерью, настаивающей на скорейшем замужестве дочери, приводят к тому, что Арте изъявляет желание стать ученицей в какой-нибудь художественной мастерской. «Если уж сожалеть о чём-то, то только после того, как совершу желаемое», — говорит она. Здесь начинается жизненный путь Арте — девушки, принявшей решение стать художницей, вопреки веяниям своей эпохи.

Перед вами мир, где человечеству угрожают таинственные существа — Безухие. Противостоять чудовищам могут лишь особые люди со встроенными в их тела аудиоразъёмами, с помощью которых они управляют боевыми роботами «эквипментами». Десять лет назад парнишка Эково, живущий в городе-свалке Ливерчестер, стал свидетелем Феста — страшной битвы, что развернулась между Безухим и легендарным героем Джими. С тех пор Эково и стал восхищаться такими, как Джими. Но вот однажды, привычно копаясь на свалке в поисках чего-нибудь полезного, он обнаруживает Мю — потерявшую память девушку. В её пояснице зияет гнездо для подключения. Чтобы выяснить, кто такая Мю, Эково и его новая подруга отправляются в путешествие на поиски таинственного героя Джими...